甘蔗光合代谢途径基因家族演化及其C_4类型基因的鉴定

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甘蔗光合代谢途径基因家族演化及其C_4类型基因的鉴定
论文目录
 
摘要第1-4页
Abstract第4-6页
中文文摘第6-13页
绪论第13-23页
1.研究背景第13-16页
  1.1 甘蔗的生物学特性第13页
  1.2 甘蔗叶片的结构特征第13-14页
  1.3 甘蔗主要品种之间的光合效率比较第14-15页
  1.4 甘蔗光合作用分子机制的研究进展第15-16页
2.C_4植物光合作用的研究进展第16-21页
  2.1 C_4光合作用第16页
  2.2 C_4光合作用的生理生化机制第16-18页
  2.3 植物中C_4光合途径关键酶的研究进展第18-21页
    2.3.1 CA第18-19页
    2.3.2 PEPC第19页
    2.3.3 PPCK第19页
    2.3.4 NADP-MDH第19-20页
    2.3.5 NADP-ME第20页
    2.3.6 PPDK第20页
    2.3.7 PPDK-RP第20-21页
3.本研究的目的和意义第21-23页
第一章 甘蔗CA基因家族的鉴定及演化分析第23-33页
第一节 前言第23页
第二节 实验方法第23-24页
  2.1 比较基因组学方法预测甘蔗CA基因家族第23页
  2.2 植物CA基因家族系统进化树的构建第23-24页
  2.3 甘蔗CA基因家族的注释第24页
第三节 结果与分析第24-30页
  3.1 植物CA基因家族系统分析第24-27页
  3.2 甘蔗CA基因家族的鉴定及比较分析第27-29页
  3.3 CA基因家族选择压力分析第29-30页
第四节 讨论第30-33页
第二章 甘蔗PEPC和PPCK基因家族的鉴定及演化分析第33-45页
第一节 前言第33页
第二节 实验方法第33页
第三节 结果与分析第33-43页
  3.1 植物PEPC和PPCK基因家族系统分析第33-37页
  3.2 甘蔗PEPC基因家族的鉴定及比较分析第37-40页
  3.3 甘蔗PPCK基因家族的鉴定及比较分析第40-42页
  3.4 PEPC基因家族选择压力分析第42-43页
  3.5 PPCK基因家族选择压力分析第43页
第四节 讨论第43-45页
第三章 甘蔗NADP-MDH基因家族的鉴定及演化分析第45-51页
第一节 前言第45页
第二节 实验方法第45页
第三节 结果与分析第45-50页
  3.1 植物NADP-MDH基因家族系统分析第45-47页
  3.2 NADP-MDH家族基因的等位基因进化分析第47-49页
  3.3 NADP-MDH基因家族选择压力分析第49-50页
第四节 讨论第50-51页
第四章 甘蔗NADP-ME基因家族的鉴定及演化分析第51-59页
第一节 前言第51页
第二节 实验方法第51页
第三节 结果与分析第51-58页
  3.1 植物NADP-ME基因家族系统分析第51-54页
  3.2 NADP-ME家族基因的等位基因进化分析第54-57页
  3.3 NADP-ME基因家族选择压力分析第57-58页
第四节 讨论第58-59页
第五章 甘蔗PPDK和PPDK-RP基因家族的鉴定及演化分析第59-69页
第一节 前言第59页
第二节 实验方法第59页
第三节 结果与分析第59-67页
  3.1 植物PPDK和PPDK-RP基因家族系统分析第59-61页
  3.2 PPDK家族基因的等位基因进化分析第61-63页
  3.3 PPDK-RP家族基因的等位基因进化分析第63-65页
  3.4 PPDK基因家族选择压力分析第65-66页
  3.5 PPDK-RP基因家族选择压力分析第66-67页
第四节 讨论第67-69页
第六章 甘蔗C_4光合途径相关基因家族的表达量分析第69-101页
第一节 前言第69页
第二节 材料和试剂第69-71页
  2.1 植物材料第69页
  2.2 试剂和仪器第69-71页
    2.2.1 试剂第70页
    2.2.2 仪器第70-71页
第三节 实验方法第71-76页
  3.1 甘蔗叶片解剖观察第71-74页
    3.1.1 石蜡切片第71-73页
    3.1.2 电镜切片第73-74页
  3.2 甘蔗叶片的RNA-seq第74-75页
    3.2.1 甘蔗叶片RNA的提取第74页
    3.2.2 甘蔗叶片RNA样品检测第74页
    3.2.3 甘蔗RNA文库的构建第74-75页
    3.2.4 甘蔗RNA-seq定量分析第75页
  3.3 甘蔗C_4光合途径相关基因家族qRT-PCR分析第75-76页
第四节 结果与分析第76-98页
  4.1 甘蔗叶片解剖学观察第76-78页
  4.2 甘蔗总RNA提取及质量检测第78页
  4.3 甘蔗光合代谢基因家族在甘蔗梯度发育叶片上的表达的比较第78-86页
    4.3.1 CA基因在甘蔗梯度发育叶片上的表达第79-80页
    4.3.2 PEPC基因在甘蔗梯度发育叶片上的表达第80-81页
    4.3.3 PPCK基因在甘蔗梯度发育叶片上的表达第81-82页
    4.3.4 NADP-MDH基因在甘蔗梯度发育叶片上的表达第82-83页
    4.3.5 NADP-ME基因在甘蔗梯度发育叶片上的表达第83-84页
    4.3.6 PPDK基因在甘蔗梯度发育叶片上的表达第84-85页
    4.3.7 PPDK-RP基因在甘蔗梯度发育叶片上的表达第85-86页
  4.4 光合代谢途径基因家族在甘蔗、玉米、水稻梯度发育叶片上的表达的比较第86-87页
  4.5 甘蔗光合代谢途径基因家族在苗期、成熟前期和成熟期共表达分析第87-97页
    4.5.1 CA在甘蔗苗期、成熟前期和成熟期共表达分析第88-89页
    4.5.2 PEPC在甘蔗苗期、成熟前期和成熟期共表达分析第89-91页
    4.5.3 PPCK在甘蔗苗期、成熟前期和成熟期共表达分析第91-92页
    4.5.4 NADP-MDH在甘蔗苗期、成熟前期和成熟期共表达分析第92-93页
    4.5.5 NADP-ME在甘蔗苗期、成熟前期和成熟期共表达分析第93-95页
    4.5.6 PPDK在甘蔗苗期、成熟前期和成熟期共表达分析第95-96页
    4.5.7 PPDK-RP在甘蔗苗期、成熟前期和成熟期共表达分析第96-97页
  4.6 qRT-PCR验证RNA-seq数据第97-98页
第五节 讨论第98-101页
第七章 结论第101-103页
附录1 名词缩写表第103-105页
参考文献第105-111页
攻读学位期间承担的科研任务与主要成果第111-113页
致谢第113-115页
个人简历第115-117页

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